Le Laboratoire Ampère est structuré par disciplines scientifiques en 3 « Départements de recherche » pérennes auxquels sont rattachés les chercheurs :
- Energie Electrique (EE) - Direction : C. Joubert
- Bio-Ingénierie (BI) - Direction : M. Frénéa-Robin et G. Nicol
- Méthodes pour l’Ingénierie des Systèmes (MIS) - Direction : E. Bideaux
Chaque chercheur met ses compétences au service d’une ou plusieurs « Priorités scientifiques », ces priorités sont actuellement les suivantes :
- Systèmes et performance (M1 = Méthodes 1) - Coordination : M. Di Loreto
- Systèmes et multi-énergie (M2 = Méthodes 2) - Coordination : M.-T. Pham
- Systèmes et énergies sûrs (T1= Transverse 1) - Coordination : P. Venet
- Composants haute-tension et constituants de réseaux (E1 Energie 1) :
Coordination : A. Béroual
- Conversion sous contraintes sévères (E2 = Energie 2) - Coordination : C. Martin
- Biomicrosystèmes, bioélectrochimie et bioélectromagnétisme (T2 = Transverse 2)
Coordination : M. Frénéa-Robin
- Exploration des communautés bactériennes en relation avec leur environnement (B1 = Bio Ing. 1)
Coordination : G. Nicol